Ưu điểm nổi bật của QR Pay so với nhiều hình thức thanh toán di động khác hiện nay đó là: Tích hợp sẵn trên ứng dụng ngân hàng, người dùng không cần tải thêm ứng dụng, liên kết thẻ, hay phải chuyển tiền qua lại để thanh toán. Thanh toán bằng QR Pay cũng được đánh giá là an toàn và bảo mật hơn. Điều đó giúp khách hàng hoàn toàn làm chủ quá trình thanh toán trên di động của mình, không cần cung cấp số tài khoản, số thẻ cho bất kỳ ai hay phải để lại trên website khi mua sắm trực tuyến.